Coronavirus outbreak; COVID-19

Disclaimer: This is a personal communication to my friends and family.

Mardi soir 25 fevrier 2020, le nombre de cas confirmes de coronovirus, SARS-CoV-2 (son nom), est pres de 81,000,  avec 30,000 cas gueris de COVID-19 (la maladie causee par le virus) et 2760 deces. Sachant que les chiffres officiels de la Chine, communist country of liars, peuvent etre multiplies (par un coefficient plus ou moins grand) pour une approximation plus realiste.

Website de John Hopkins University Medical Center, Baltimore
25 fevrier au soir

Qu'est ce que c'est que ce virus ?
Coronavirus, SARS-CoV-2, est un virus a RNA (comme la rage, Ebola, SARS, influenza, hepatites, polio....). Il existe deux types de virus, classes selon leur materiel genetique: les virus a RNA et les virus a DNA. Les virus a RNA peuvent etre directement transcrits par la cellule hote (la cellule humaine infectee), sans passer par une phase DNA intermediate-RNA. Ces virus a RNA sont de plusieurs sortes (simple brin, double brins, sense et anti-sense). 
Le RNA virus possede une enzyme, la reverse transcriptase, qui convertit le RNA viral en un brin complementaire de DNA, qui est recopie dans la cellule pour produire un double brin de DNA viral et integre au genome de la cellule hote a l'aide de l'enzyme integrase, produite par le virus. L'expression des genes encodes produit de nouveaux virions.

Les virus a RNA ayant un DNA intermediate sont appeles retrovirus (comme HIV-1, HIV-2)
Ces RNA viruses ont un taux de mutation tres eleve compare aux DNA viruses (tout comme les retrovirus egalement). C'est la raison pour laquelle il est difficile de produire des vaccins efficaces pour la prevention des maladies causees par les virus a RNA.
Coronavirus est un simple brin sense RNA virus, classe dans le groupe IV de la classification de Baltimore (positive sense single stranded RNA virus), de la famille coronaviridae (Cette famille comprends egalement SARS)
En conclusion: Le virus a un taux d'infectivite eleve et mute facilement (difficile de mettre au point un vaccin).

Ce que l'on sait de Coronavirus, SARS-CoV-2 et COVID-19 (Donnees du Center for Disease Control and prevention, CDC, HHS):
Les donnees sont essentiellement basees sur ce que l'on connait des coronaviruses similaires.
La famille des coronaviruses est largement presente dans le monde animal, particulierement chez les chameaux, chats, moutons et chauve-souris (qui sont des reservoirs a virus). La transmission a l'homme est tres rare, excepte pour MERS-CoV, SARS-CoV et SARS-CoV-2. La transmission s'est operee de l'animal a l'homme dans la region de Wuhan, Chine. La sequence du virus chez les patients US est identique a celle du virus en Chine, et provient d'un reservoir animal.

Transmission:
Le virus est essentiellement transmis de personne a personne (proximite), par des productions respiratoires, microscopiques gouttelettes expulsee en eternuant, toussant ou expectorant. Il peut etre egalement transmis par des surfaces contaminees (comme des cuvettes de toilette). Les gens infectes sont les plus contagieux au maximum de la severite de la maladie (lorsqu'ils sont le plus malade)

Infection: La maladie respiratoire reportee apres infection avec le virus (COVID-19) presente un large panel de symptomes et severite, de moderee a severe, pouvant conduire au deces. Les symptomes sont ceux d'une grippe ou  infection respiratoire moderee, avec fievre ou bien sur infection respiratoire plus severe. Cette partie n'est pas encore completement comprise et maitrisee. 

Pandemie ?
L'epidemie au dela des frontieres est inevitable dans le monde d'aujourd'hui et le monitoring, la prevention et le potentiel traitement permettrons de limiter une possible pandemie.
Pour illustrer la vitesse de contagion, voici des snapshots du website de John Hopkins qui monitore les chiffres en temps reel, pour completer ma premiere photo:

26 fevrier au matin

26 fevrier debut d'apres-midi

26 fevrier au soir

Carte du monde, en bleu les pays contamines

Que peut-on faire en prevention ?
Au niveau national: Les US ont un ban sur certaines destinations, dont bien entendu la Chine, mais d'autres pays sont consideres a risque (4 niveaux de risque chez nous, de 1 a 4; La Chine est niveau 4, l'Italie etait ce soir niveau 2). Les nationaux rentrant de Chine ont une quarantaine imposee de 2 semaines, particulierement s'ils reviennent de la region de Wuhan (il n'est pas encore certain que 2 semaines representent un taux d'incubation maximum). De meme les croisieres revenant d'Asie. Les touristes Chinois sont pour le moment refoules et ne peuvent pas entrer sur le territoire.
Au niveau individuel: 
- Evidemment, eviter les endroits contamines, a risque, et les personnes contaminees ou a risque
- Eviter les foules, les endroits tres frequentes comme les metros, trains bondes, avions, toilettes publiques, la promiscuite.
- Se laver scrupuleusement les mains frequemment avec du savon en insistant au moins 20 secondes
- decontaminer les surfaces, laver a la javel et a l'alcohol (cuvettes de toilettes...)
- Ne pas se toucher les yeux, le bouche ou le nez avec les mains
- Ne PAS porter de masque, sauf si vous etes vous-meme contamine
- Booster au mieux son systeme immunitaire (je preconise un maximum de vitamine C et de repos et sommeil)

Qu'en est-il de potentiels traitements ?
Deux etudes cliniques: 
Gilead Science a demarre hier une etude au NIH de test clinique d'un medicament anti-viral experimental chez les patients infectes par coronavirus.
Moderna a produit un premier Batch de candidat C vaccin pour etre teste.

Et ensuite ?
L'organisation mondiale de la sante (OMS), WHO (World Health Organization) envoie pour le moment des signaux contradictoires concernant une possible pandemie. La presse relaie en general des informations erronees et alarmistes.
Les grands virologistes prennent la parole pour emettre des informations precautionneuses (Tony Fauci chez nous est le grand specialiste de HIV et a traverse vitorieusement la crise de AIDS durant les annees 80-95)
Les donnees actuelles ne sont pas suffisantes pour faire une quelconque projection a long terme.

Mon conseil :
Pas de panique !!! (No panic !!) Aucune raison de s'alarmer pour le moment, mais restons vigilant et surtout agissons en prevention avec juste un peu de bon sens...

Petit complement: fevrier 27, 2020: 60 cas confirmes, surtout sur la cote West, California, qui monitore en ce moment plus de 8000 potentiels. Les cas sont de severite moyenne et aucun mort.